Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHS1P30084 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHS1P30084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms