Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCAP28676 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCAP28676 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCAP28676 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCAP28676 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCAP28676 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCAP28676 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCAP28676 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCAP28676 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCAP28676 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCAP28676 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCAP28676 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCAP28676 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCAP28676 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCAP28676 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCAP28676 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCAP28676 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCAP28676 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCAP28676 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCAP28676 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCAP28676 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCAP28676 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCAP28676 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCAP28676 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCAP28676 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCAP28676 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCAP28676 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCAP28676 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCAP28676 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCAP28676 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCAP28676 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCAP28676 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCAP28676 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCAP28676 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCAP28676 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCAP28676 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCAP28676 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCAP28676 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCAP28676 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCAP28676 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCAP28676 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCAP28676 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCAP28676 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCAP28676 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCAP28676 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCAP28676 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCAP28676 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCAP28676 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCAP28676 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCAP28676 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCAP28676 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCAP28676 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCAP28676 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCAP28676 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCAP28676 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCAP28676 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCAP28676 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms