Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLD1P28340 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLD1P28340 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLD1P28340 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLD1P28340 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLD1P28340 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
POLD1P28340 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLD1P28340 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLD1P28340 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLD1P28340 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLD1P28340 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLD1P28340 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLD1P28340 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLD1P28340 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLD1P28340 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLD1P28340 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLD1P28340 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLD1P28340 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
POLD1P28340 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLD1P28340 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
POLD1P28340 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
POLD1P28340 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLD1P28340 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLD1P28340 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLD1P28340 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLD1P28340 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLD1P28340 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLD1P28340 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLD1P28340 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
POLD1P28340 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
POLD1P28340 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
POLD1P28340 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
POLD1P28340 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
POLD1P28340 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLD1P28340 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
POLD1P28340 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
POLD1P28340 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
POLD1P28340 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLD1P28340 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLD1P28340 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLD1P28340 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLD1P28340 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLD1P28340 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLD1P28340 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLD1P28340 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
POLD1P28340 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLD1P28340 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLD1P28340 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLD1P28340 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLD1P28340 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
POLD1P28340 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
POLD1P28340 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLD1P28340 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
POLD1P28340 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
POLD1P28340 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLD1P28340 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLD1P28340 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLD1P28340 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLD1P28340 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
POLD1P28340 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLD1P28340 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLD1P28340 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLD1P28340 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLD1P28340 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLD1P28340 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLD1P28340 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLD1P28340 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLD1P28340 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLD1P28340 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLD1P28340 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms