Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARK3P27448 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARK3P27448 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARK3P27448 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARK3P27448 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARK3P27448 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARK3P27448 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARK3P27448 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARK3P27448 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARK3P27448 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARK3P27448 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARK3P27448 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARK3P27448 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARK3P27448 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MARK3P27448 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARK3P27448 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARK3P27448 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARK3P27448 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARK3P27448 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARK3P27448 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARK3P27448 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARK3P27448 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARK3P27448 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARK3P27448 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARK3P27448 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARK3P27448 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARK3P27448 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARK3P27448 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARK3P27448 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARK3P27448 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARK3P27448 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARK3P27448 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARK3P27448 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARK3P27448 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARK3P27448 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARK3P27448 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARK3P27448 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MARK3P27448 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARK3P27448 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARK3P27448 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MARK3P27448 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARK3P27448 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARK3P27448 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARK3P27448 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARK3P27448 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARK3P27448 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARK3P27448 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARK3P27448 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MARK3P27448 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARK3P27448 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARK3P27448 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARK3P27448 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARK3P27448 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARK3P27448 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARK3P27448 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARK3P27448 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARK3P27448 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARK3P27448 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARK3P27448 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARK3P27448 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARK3P27448 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARK3P27448 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARK3P27448 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MARK3P27448 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARK3P27448 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MARK3P27448 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MARK3P27448 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARK3P27448 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARK3P27448 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARK3P27448 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARK3P27448 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARK3P27448 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARK3P27448 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARK3P27448 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARK3P27448 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARK3P27448 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MARK3P27448 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARK3P27448 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARK3P27448 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARK3P27448 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARK3P27448 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MARK3P27448 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARK3P27448 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms