Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPAP23025 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPAP23025 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPAP23025 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPAP23025 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPAP23025 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPAP23025 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPAP23025 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPAP23025 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XPAP23025 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPAP23025 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPAP23025 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPAP23025 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPAP23025 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPAP23025 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPAP23025 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPAP23025 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPAP23025 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPAP23025 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPAP23025 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPAP23025 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPAP23025 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPAP23025 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPAP23025 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPAP23025 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPAP23025 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPAP23025 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
XPAP23025 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XPAP23025 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPAP23025 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPAP23025 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPAP23025 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPAP23025 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPAP23025 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPAP23025 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XPAP23025 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XPAP23025 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XPAP23025 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPAP23025 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPAP23025 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPAP23025 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPAP23025 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPAP23025 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPAP23025 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPAP23025 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPAP23025 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPAP23025 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPAP23025 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPAP23025 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPAP23025 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPAP23025 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPAP23025 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPAP23025 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPAP23025 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPAP23025 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPAP23025 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XPAP23025 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPAP23025 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPAP23025 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPAP23025 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XPAP23025 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms