Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPI1P17947 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPI1P17947 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPI1P17947 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPI1P17947 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPI1P17947 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPI1P17947 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPI1P17947 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPI1P17947 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPI1P17947 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPI1P17947 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPI1P17947 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPI1P17947 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPI1P17947 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPI1P17947 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPI1P17947 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPI1P17947 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPI1P17947 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPI1P17947 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPI1P17947 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPI1P17947 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPI1P17947 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPI1P17947 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPI1P17947 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPI1P17947 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPI1P17947 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPI1P17947 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPI1P17947 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPI1P17947 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPI1P17947 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPI1P17947 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPI1P17947 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPI1P17947 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPI1P17947 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPI1P17947 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPI1P17947 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPI1P17947 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPI1P17947 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPI1P17947 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPI1P17947 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPI1P17947 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPI1P17947 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPI1P17947 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPI1P17947 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPI1P17947 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPI1P17947 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPI1P17947 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPI1P17947 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms