Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DESP17661 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DESP17661 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DESP17661 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DESP17661 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DESP17661 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DESP17661 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DESP17661 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DESP17661 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DESP17661 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DESP17661 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DESP17661 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DESP17661 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DESP17661 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DESP17661 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DESP17661 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DESP17661 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DESP17661 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DESP17661 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DESP17661 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DESP17661 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DESP17661 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DESP17661 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DESP17661 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DESP17661 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DESP17661 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DESP17661 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DESP17661 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DESP17661 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DESP17661 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DESP17661 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DESP17661 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DESP17661 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DESP17661 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DESP17661 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DESP17661 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DESP17661 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DESP17661 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DESP17661 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DESP17661 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DESP17661 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DESP17661 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DESP17661 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DESP17661 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DESP17661 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DESP17661 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DESP17661 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DESP17661 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DESP17661 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DESP17661 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DESP17661 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DESP17661 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DESP17661 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DESP17661 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DESP17661 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DESP17661 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DESP17661 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DESP17661 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DESP17661 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DESP17661 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DESP17661 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DESP17661 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DESP17661 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DESP17661 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DESP17661 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DESP17661 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DESP17661 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DESP17661 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DESP17661 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DESP17661 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DESP17661 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DESP17661 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DESP17661 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DESP17661 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DESP17661 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DESP17661 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DESP17661 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DESP17661 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DESP17661 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DESP17661 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DESP17661 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DESP17661 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DESP17661 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms