Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STMN1P16949 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STMN1P16949 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STMN1P16949 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STMN1P16949 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STMN1P16949 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STMN1P16949 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMN1P16949 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMN1P16949 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STMN1P16949 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMN1P16949 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMN1P16949 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMN1P16949 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMN1P16949 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMN1P16949 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMN1P16949 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STMN1P16949 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STMN1P16949 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STMN1P16949 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STMN1P16949 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STMN1P16949 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STMN1P16949 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STMN1P16949 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STMN1P16949 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STMN1P16949 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STMN1P16949 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STMN1P16949 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STMN1P16949 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STMN1P16949 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STMN1P16949 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STMN1P16949 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STMN1P16949 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STMN1P16949 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STMN1P16949 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STMN1P16949 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STMN1P16949 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMN1P16949 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMN1P16949 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMN1P16949 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMN1P16949 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMN1P16949 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STMN1P16949 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STMN1P16949 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STMN1P16949 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMN1P16949 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMN1P16949 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMN1P16949 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMN1P16949 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMN1P16949 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMN1P16949 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STMN1P16949 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STMN1P16949 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STMN1P16949 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STMN1P16949 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STMN1P16949 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms