Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ITGB4P16144 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITGB4P16144 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
ITGB4P16144 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITGB4P16144 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms