Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FDPSP14324 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDPSP14324 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDPSP14324 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDPSP14324 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDPSP14324 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDPSP14324 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FDPSP14324 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FDPSP14324 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FDPSP14324 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FDPSP14324 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FDPSP14324 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FDPSP14324 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FDPSP14324 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FDPSP14324 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FDPSP14324 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FDPSP14324 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDPSP14324 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDPSP14324 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FDPSP14324 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDPSP14324 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FDPSP14324 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDPSP14324 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FDPSP14324 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FDPSP14324 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDPSP14324 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDPSP14324 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FDPSP14324 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FDPSP14324 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FDPSP14324 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FDPSP14324 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FDPSP14324 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FDPSP14324 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDPSP14324 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDPSP14324 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDPSP14324 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDPSP14324 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FDPSP14324 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDPSP14324 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FDPSP14324 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FDPSP14324 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FDPSP14324 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FDPSP14324 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FDPSP14324 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FDPSP14324 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FDPSP14324 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FDPSP14324 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FDPSP14324 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FDPSP14324 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FDPSP14324 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FDPSP14324 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FDPSP14324 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FDPSP14324 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FDPSP14324 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FDPSP14324 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FDPSP14324 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FDPSP14324 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FDPSP14324 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FDPSP14324 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FDPSP14324 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FDPSP14324 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FDPSP14324 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FDPSP14324 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FDPSP14324 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FDPSP14324 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FDPSP14324 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FDPSP14324 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FDPSP14324 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FDPSP14324 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FDPSP14324 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FDPSP14324 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FDPSP14324 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FDPSP14324 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FDPSP14324 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FDPSP14324 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FDPSP14324 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FDPSP14324 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FDPSP14324 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FDPSP14324 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FDPSP14324 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FDPSP14324 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FDPSP14324 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FDPSP14324 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FDPSP14324 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FDPSP14324 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FDPSP14324 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FDPSP14324 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1281.2 ms