Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFHP12036 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFHP12036 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFHP12036 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEFHP12036 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFHP12036 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFHP12036 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFHP12036 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFHP12036 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEFHP12036 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFHP12036 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFHP12036 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFHP12036 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFHP12036 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFHP12036 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFHP12036 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFHP12036 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFHP12036 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFHP12036 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFHP12036 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFHP12036 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFHP12036 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFHP12036 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFHP12036 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFHP12036 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFHP12036 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFHP12036 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFHP12036 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFHP12036 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFHP12036 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFHP12036 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFHP12036 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFHP12036 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFHP12036 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFHP12036 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFHP12036 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFHP12036 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFHP12036 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFHP12036 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFHP12036 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFHP12036 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFHP12036 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFHP12036 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFHP12036 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFHP12036 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFHP12036 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEFHP12036 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEFHP12036 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFHP12036 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFHP12036 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFHP12036 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEFHP12036 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEFHP12036 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFHP12036 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEFHP12036 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms