Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODC1P11926 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODC1P11926 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODC1P11926 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ODC1P11926 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODC1P11926 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODC1P11926 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODC1P11926 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODC1P11926 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODC1P11926 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODC1P11926 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ODC1P11926 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ODC1P11926 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ODC1P11926 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ODC1P11926 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ODC1P11926 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ODC1P11926 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODC1P11926 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODC1P11926 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODC1P11926 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODC1P11926 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ODC1P11926 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ODC1P11926 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODC1P11926 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODC1P11926 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODC1P11926 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODC1P11926 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ODC1P11926 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODC1P11926 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ODC1P11926 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODC1P11926 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODC1P11926 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODC1P11926 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODC1P11926 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ODC1P11926 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ODC1P11926 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODC1P11926 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODC1P11926 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODC1P11926 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODC1P11926 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODC1P11926 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODC1P11926 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ODC1P11926 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODC1P11926 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODC1P11926 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODC1P11926 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODC1P11926 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ODC1P11926 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODC1P11926 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODC1P11926 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODC1P11926 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODC1P11926 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ODC1P11926 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ODC1P11926 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ODC1P11926 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ODC1P11926 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ODC1P11926 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ODC1P11926 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ODC1P11926 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ODC1P11926 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ODC1P11926 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ODC1P11926 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ODC1P11926 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ODC1P11926 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODC1P11926 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODC1P11926 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODC1P11926 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ODC1P11926 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODC1P11926 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODC1P11926 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODC1P11926 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODC1P11926 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ODC1P11926 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ODC1P11926 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ODC1P11926 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ODC1P11926 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ODC1P11926 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ODC1P11926 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ODC1P11926 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODC1P11926 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODC1P11926 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODC1P11926 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODC1P11926 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODC1P11926 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODC1P11926 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ODC1P11926 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODC1P11926 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODC1P11926 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODC1P11926 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ODC1P11926 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ODC1P11926 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222 ms