Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DMDP11532 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DMDP11532 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DMDP11532 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DMDP11532 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DMDP11532 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DMDP11532 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DMDP11532 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DMDP11532 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DMDP11532 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DMDP11532 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DMDP11532 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DMDP11532 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DMDP11532 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DMDP11532 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DMDP11532 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DMDP11532 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DMDP11532 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DMDP11532 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DMDP11532 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DMDP11532 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DMDP11532 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DMDP11532 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DMDP11532 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DMDP11532 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DMDP11532 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DMDP11532 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DMDP11532 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DMDP11532 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DMDP11532 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DMDP11532 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DMDP11532 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DMDP11532 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DMDP11532 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DMDP11532 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DMDP11532 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DMDP11532 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DMDP11532 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DMDP11532 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DMDP11532 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DMDP11532 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DMDP11532 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DMDP11532 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DMDP11532 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DMDP11532 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DMDP11532 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DMDP11532 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DMDP11532 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DMDP11532 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DMDP11532 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DMDP11532 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DMDP11532 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DMDP11532 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DMDP11532 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DMDP11532 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DMDP11532 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DMDP11532 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DMDP11532 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DMDP11532 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DMDP11532 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DMDP11532 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DMDP11532 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DMDP11532 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DMDP11532 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DMDP11532 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
DMDP11532 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DMDP11532 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DMDP11532 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DMDP11532 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DMDP11532 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DMDP11532 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DMDP11532 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DMDP11532 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DMDP11532 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DMDP11532 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms