Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYP3A4P08684 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYP3A4P08684 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYP3A4P08684 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms