Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLC3A2P08195 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC3A2P08195 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC3A2P08195 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC3A2P08195 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms