Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN2P04844 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN2P04844 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN2P04844 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN2P04844 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPN2P04844 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN2P04844 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN2P04844 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN2P04844 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN2P04844 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN2P04844 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN2P04844 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPN2P04844 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPN2P04844 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN2P04844 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN2P04844 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN2P04844 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN2P04844 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN2P04844 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPN2P04844 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN2P04844 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN2P04844 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN2P04844 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN2P04844 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPN2P04844 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPN2P04844 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPN2P04844 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPN2P04844 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPN2P04844 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPN2P04844 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPN2P04844 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPN2P04844 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPN2P04844 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPN2P04844 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPN2P04844 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPN2P04844 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPN2P04844 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPN2P04844 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RPN2P04844 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPN2P04844 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPN2P04844 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPN2P04844 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPN2P04844 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPN2P04844 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPN2P04844 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPN2P04844 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPN2P04844 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPN2P04844 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPN2P04844 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPN2P04844 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPN2P04844 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPN2P04844 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPN2P04844 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPN2P04844 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPN2P04844 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPN2P04844 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPN2P04844 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPN2P04844 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPN2P04844 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPN2P04844 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPN2P04844 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPN2P04844 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPN2P04844 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPN2P04844 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPN2P04844 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPN2P04844 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN2P04844 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN2P04844 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN2P04844 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN2P04844 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN2P04844 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN2P04844 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPN2P04844 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN2P04844 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN2P04844 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN2P04844 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN2P04844 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN2P04844 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN2P04844 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN2P04844 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN2P04844 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN2P04844 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN2P04844 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN2P04844 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN2P04844 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms