Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPN1P04843 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPN1P04843 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPN1P04843 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPN1P04843 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPN1P04843 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPN1P04843 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPN1P04843 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPN1P04843 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPN1P04843 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPN1P04843 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPN1P04843 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPN1P04843 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPN1P04843 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPN1P04843 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPN1P04843 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPN1P04843 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPN1P04843 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPN1P04843 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPN1P04843 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPN1P04843 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPN1P04843 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPN1P04843 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPN1P04843 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RPN1P04843 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPN1P04843 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPN1P04843 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPN1P04843 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RPN1P04843 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPN1P04843 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPN1P04843 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPN1P04843 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPN1P04843 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPN1P04843 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPN1P04843 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPN1P04843 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPN1P04843 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPN1P04843 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPN1P04843 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPN1P04843 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPN1P04843 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPN1P04843 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPN1P04843 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPN1P04843 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPN1P04843 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPN1P04843 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPN1P04843 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPN1P04843 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPN1P04843 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPN1P04843 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPN1P04843 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPN1P04843 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPN1P04843 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPN1P04843 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPN1P04843 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPN1P04843 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPN1P04843 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPN1P04843 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPN1P04843 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPN1P04843 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPN1P04843 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPN1P04843 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPN1P04843 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPN1P04843 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPN1P04843 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPN1P04843 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPN1P04843 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPN1P04843 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPN1P04843 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms