Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TUBB4AP04350 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBB4AP04350 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBB4AP04350 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms