Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSTAP01040 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSTAP01040 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTAP01040 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTAP01040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTAP01040 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTAP01040 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTAP01040 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTAP01040 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSTAP01040 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTAP01040 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTAP01040 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTAP01040 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSTAP01040 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTAP01040 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTAP01040 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTAP01040 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTAP01040 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTAP01040 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTAP01040 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSTAP01040 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTAP01040 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTAP01040 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTAP01040 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSTAP01040 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSTAP01040 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTAP01040 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTAP01040 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTAP01040 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSTAP01040 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSTAP01040 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTAP01040 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTAP01040 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTAP01040 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTAP01040 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTAP01040 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSTAP01040 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSTAP01040 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTAP01040 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTAP01040 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSTAP01040 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTAP01040 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTAP01040 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTAP01040 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTAP01040 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTAP01040 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTAP01040 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSTAP01040 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTAP01040 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTAP01040 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTAP01040 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTAP01040 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSTAP01040 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTAP01040 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTAP01040 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTAP01040 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTAP01040 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSTAP01040 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSTAP01040 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTAP01040 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTAP01040 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTAP01040 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTAP01040 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTAP01040 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSTAP01040 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTAP01040 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSTAP01040 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSTAP01040 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSTAP01040 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms