Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WISP3O95389 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WISP3O95389 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WISP3O95389 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WISP3O95389 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WISP3O95389 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WISP3O95389 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WISP3O95389 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WISP3O95389 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WISP3O95389 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
WISP3O95389 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WISP3O95389 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WISP3O95389 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WISP3O95389 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WISP3O95389 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WISP3O95389 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WISP3O95389 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WISP3O95389 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WISP3O95389 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WISP3O95389 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WISP3O95389 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WISP3O95389 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WISP3O95389 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WISP3O95389 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WISP3O95389 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WISP3O95389 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WISP3O95389 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WISP3O95389 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WISP3O95389 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WISP3O95389 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WISP3O95389 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WISP3O95389 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WISP3O95389 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WISP3O95389 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WISP3O95389 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WISP3O95389 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WISP3O95389 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WISP3O95389 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WISP3O95389 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WISP3O95389 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WISP3O95389 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WISP3O95389 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WISP3O95389 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WISP3O95389 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WISP3O95389 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WISP3O95389 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WISP3O95389 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WISP3O95389 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WISP3O95389 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
WISP3O95389 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
WISP3O95389 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms