Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATE1O95260 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATE1O95260 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATE1O95260 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATE1O95260 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATE1O95260 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATE1O95260 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATE1O95260 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATE1O95260 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATE1O95260 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATE1O95260 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATE1O95260 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATE1O95260 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATE1O95260 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATE1O95260 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATE1O95260 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATE1O95260 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATE1O95260 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATE1O95260 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATE1O95260 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATE1O95260 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATE1O95260 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATE1O95260 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATE1O95260 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATE1O95260 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATE1O95260 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATE1O95260 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATE1O95260 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATE1O95260 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATE1O95260 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATE1O95260 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATE1O95260 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATE1O95260 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATE1O95260 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATE1O95260 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATE1O95260 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATE1O95260 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATE1O95260 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATE1O95260 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATE1O95260 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATE1O95260 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATE1O95260 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATE1O95260 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATE1O95260 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ATE1O95260 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATE1O95260 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATE1O95260 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATE1O95260 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATE1O95260 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms