Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEC24DO94855 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24DO94855 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24DO94855 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms