Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGR5O75473 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGR5O75473 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGR5O75473 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LGR5O75473 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LGR5O75473 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LGR5O75473 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LGR5O75473 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LGR5O75473 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LGR5O75473 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LGR5O75473 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LGR5O75473 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LGR5O75473 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LGR5O75473 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGR5O75473 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGR5O75473 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGR5O75473 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGR5O75473 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LGR5O75473 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LGR5O75473 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LGR5O75473 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LGR5O75473 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LGR5O75473 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LGR5O75473 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LGR5O75473 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LGR5O75473 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LGR5O75473 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LGR5O75473 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LGR5O75473 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LGR5O75473 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LGR5O75473 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LGR5O75473 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LGR5O75473 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LGR5O75473 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LGR5O75473 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LGR5O75473 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LGR5O75473 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LGR5O75473 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LGR5O75473 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LGR5O75473 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LGR5O75473 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LGR5O75473 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LGR5O75473 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LGR5O75473 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LGR5O75473 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LGR5O75473 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LGR5O75473 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LGR5O75473 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LGR5O75473 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LGR5O75473 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LGR5O75473 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LGR5O75473 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LGR5O75473 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LGR5O75473 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LGR5O75473 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LGR5O75473 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LGR5O75473 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LGR5O75473 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LGR5O75473 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LGR5O75473 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LGR5O75473 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LGR5O75473 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LGR5O75473 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LGR5O75473 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LGR5O75473 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LGR5O75473 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LGR5O75473 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGR5O75473 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGR5O75473 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LGR5O75473 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGR5O75473 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGR5O75473 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGR5O75473 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LGR5O75473 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LGR5O75473 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LGR5O75473 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LGR5O75473 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LGR5O75473 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LGR5O75473 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LGR5O75473 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGR5O75473 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGR5O75473 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGR5O75473 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGR5O75473 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LGR5O75473 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LGR5O75473 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LGR5O75473 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LGR5O75473 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LGR5O75473 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LGR5O75473 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LGR5O75473 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LGR5O75473 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms