Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA3O75145 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPFIA3O75145 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIA3O75145 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIA3O75145 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms