Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRPX2O60687 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRPX2O60687 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRPX2O60687 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms