Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS11DO60235 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS11DO60235 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS11DO60235 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms