Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC11O43248 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC11O43248 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC11O43248 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC11O43248 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC11O43248 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC11O43248 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC11O43248 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC11O43248 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms