Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2DO15399 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2DO15399 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2DO15399 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2DO15399 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2DO15399 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2DO15399 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIN2DO15399 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN2DO15399 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms