Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP73O15350 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP73O15350 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP73O15350 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TP73O15350 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TP73O15350 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP73O15350 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP73O15350 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP73O15350 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP73O15350 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TP73O15350 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP73O15350 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TP73O15350 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TP73O15350 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TP73O15350 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TP73O15350 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TP73O15350 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP73O15350 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP73O15350 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP73O15350 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TP73O15350 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TP73O15350 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TP73O15350 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TP73O15350 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP73O15350 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TP73O15350 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TP73O15350 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TP73O15350 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP73O15350 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP73O15350 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP73O15350 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP73O15350 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TP73O15350 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP73O15350 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP73O15350 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP73O15350 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP73O15350 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP73O15350 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TP73O15350 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP73O15350 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP73O15350 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP73O15350 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP73O15350 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP73O15350 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TP73O15350 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TP73O15350 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP73O15350 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP73O15350 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP73O15350 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP73O15350 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP73O15350 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TP73O15350 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms