Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PFDN6O15212 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFDN6O15212 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFDN6O15212 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms