Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR1AO14656 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR1AO14656 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR1AO14656 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR1AO14656 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TOR1AO14656 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TOR1AO14656 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TOR1AO14656 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TOR1AO14656 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms