Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM38O00635 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM38O00635 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM38O00635 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms