Protein–RNA interactions for Protein: A8MYZ0

MINDY4B, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4B, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4BA8MYZ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MINDY4BA8MYZ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
MINDY4BA8MYZ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MINDY4BA8MYZ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MINDY4BA8MYZ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms