Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRR3A8MPY1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRR3A8MPY1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRR3A8MPY1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms