Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
ARID3CA6NKF2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
ARID3CA6NKF2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
ARID3CA6NKF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARID3CA6NKF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARID3CA6NKF2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms