Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC12A8A0AV02 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A8A0AV02 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A8A0AV02 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A8A0AV02 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms