Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX94

PNMA6F, Paraneoplastic antigen Ma6F, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6FA0A0J9YX94 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA6FA0A0J9YX94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA6FA0A0J9YX94 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA6FA0A0J9YX94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA6FA0A0J9YX94 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA6FA0A0J9YX94 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA6FA0A0J9YX94 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA6FA0A0J9YX94 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA6FA0A0J9YX94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA6FA0A0J9YX94 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA6FA0A0J9YX94 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms