Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PAFAH1B1-203ENST00000570400 661 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-8■□□□□ 8.9
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ILF3Q12906 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.661e-8■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 AL713998.1-201ENST00000412872 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.661e-323■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.014e-6■□□□□ 8.9
ILF3Q12906 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-6■□□□□ 8.9
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ILF3Q12906 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.254e-7■□□□□ 8.9
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ILF3Q12906 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.742e-7■□□□□ 8.8
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ILF3Q12906 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 8.8
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ILF3Q12906 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.54e-6■□□□□ 8.8
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ILF3Q12906 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.614e-6■□□□□ 8.8
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ILF3Q12906 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.533e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.7
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ILF3Q12906 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 8.7
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ILF3Q12906 TRNAU1AP-207ENST00000491577 1610 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 TRNAU1AP-206ENST00000484775 1008 ntTSL 513.7□□□□□ -0.223e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 UBE4B-206ENST00000466379 2299 ntTSL 212.86□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 MBD6-214ENST00000552659 530 ntTSL 312.51□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NPRL3-208ENST00000473674 855 ntTSL 310.58□□□□□ -0.723e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.163e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 TSC22D2-203ENST00000466814 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.42□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 EFCAB14-205ENST00000484461 972 ntTSL 36.47□□□□□ -1.373e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 TSC22D2-205ENST00000485421 715 ntTSL 1 (best)5.64□□□□□ -1.513e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 UBE4B-207ENST00000470736 827 ntTSL 55.32□□□□□ -1.563e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 GNB1-203ENST00000437146 423 ntTSL 34.17□□□□□ -1.743e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 TSC22D2-204ENST00000480589 826 ntTSL 32.04□□□□□ -2.083e-6■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.24□□□□□ -2.056e-9■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.327e-9■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.297e-9■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-203ENST00000430811 860 ntTSL 225.37■■□□□ 1.651e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.691e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-213ENST00000526842 535 ntTSL 517.76■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-7■□□□□ 8.7
ILF3Q12906 SDCBP2-AS1-203ENST00000609285 561 ntTSL 413.5□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 8.7
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