Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GYQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GYQ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
V9GYQ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYQ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYQ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYQ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
V9GYQ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GYQ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GYQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GYQ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GYQ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
V9GYQ6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYQ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYQ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYQ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYQ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
V9GYQ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYQ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYQ6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYQ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYQ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYQ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
V9GYQ6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYQ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYQ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYQ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYQ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
V9GYQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
V9GYQ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
V9GYQ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
V9GYQ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
V9GYQ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYQ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYQ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYQ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYQ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
V9GYQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYQ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYQ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYQ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
V9GYQ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
V9GYQ6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
V9GYQ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
V9GYQ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GYQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GYQ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
V9GYQ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms