Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.46■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.27■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC41.26■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.23■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms