Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CAMTA1Q9Y6Y1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMTA1Q9Y6Y1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CAMTA1Q9Y6Y1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAMTA1Q9Y6Y1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms