Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX5Q9Y5X3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX5Q9Y5X3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX5Q9Y5X3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms