Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
WASHC2CQ9Y4E1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
WASHC2CQ9Y4E1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
WASHC2CQ9Y4E1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
WASHC2CQ9Y4E1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
WASHC2CQ9Y4E1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms