Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSNQ9UPA5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSNQ9UPA5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSNQ9UPA5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSNQ9UPA5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSNQ9UPA5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BSNQ9UPA5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BSNQ9UPA5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BSNQ9UPA5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSNQ9UPA5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BSNQ9UPA5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms