Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRQQ9UMZ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRQQ9UMZ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms