Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH7Q9ULB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH7Q9ULB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH7Q9ULB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms