Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJD2Q9UKL4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJD2Q9UKL4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJD2Q9UKL4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD2Q9UKL4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms