Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK45

LSM7, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM7Q9UK45 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSM7Q9UK45 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM7Q9UK45 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM7Q9UK45 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM7Q9UK45 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms