Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDF2Q9UK05 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF2Q9UK05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF2Q9UK05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms