Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RPUSD1Q9UJJ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPUSD1Q9UJJ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms